民国以前，衢江区没有民政机构。遇灾荒年份，由知县奏请赈恤或减免田赋。一些地方乐善施济者捐资或募资赈济。
民国元年（1912年）3月，西安县易名为衢县，成立县公署，县公署下首设民政科，主管民政事务。5月6日，县公署下设第一科，主管民政事务。17年，第一科易名为民治科。28年，民治科复名民政科，同时在民政科内专设户政股，负责全县户政。
1949年5月6日衢县解放，20日衢县人民政府设民政科。6月，衢州市人民政府（县级）设民政科。1950年5月15日，撤销衢州市建制，衢州市民政科并入衢县民政科。1958年10月12日，劳动科与民政科合并，仍称衢县民政科。1959年8月，析出劳动科，另建劳动工资科。“文化大革命”期间于1968年7月14日，撤销民政科，在“县革命委员会”生产指挥组下设行政组，办理民政业务。1970年5月，行政组易名为内务办公室，办理民政业务。1973年2月，撤销内务办公室，设立衢县内务局。1978年9月，衢县内务局易名为衢县民政局。
2001年12月，因区划调整，撤销衢县建制，设立衢州市衢江区，衢县民政局易名为衢州市衢江区民政局。
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